Introducción: La ventilación mecánica en posición prona es una alternativa terapéutica en  el distrés respiratorio agudo por neumonía COVID-19. Objetivo: explicar cómo aplicar el razonamiento fisiológico en la interpretación de las modificaciones de la oxigenación en pacientes con distrés respiratorio agudo por neumonía COVID-19 tratados con ventilación mecánica invasiva en decúbito prono en la unidad de cuidados intensivos del hospital Dr. Agostinho Neto durante el 2020-2021. Métodos: Se realizó un estudio analítico, retrospectivo y transversal de pacientes tratados con ventilación mecánica invasiva en decúbito prono (n =25)  o supino (VMI-DS n =25), seleccionados de modo aleatorio. Se estudiaron marcadores de oxigenación (SpO₂, SaO₂, DA-aO₂, relación PaO₂/FiO₂) medidos antes y 12 horas después de posicionarlo en prono, y el estado al egreso. Se realizó un análisis cualicuantitativo de los resultados. Se reflexionó sobre el tratamiento del tema sistema respiratorio  dentro de las ciencias biomédicas en el plan de estudio E de la carrera Medicina y la pertinencia pedagógica de aplicar el razonamiento fisiológico como alternativa didáctica para la comprensión de las variaciones de la oxigenación.   Resultados: mejoraron los  marcadores de oxigenación con la aplicación de ventilación mecánica invasiva en posición prono (p ≤ 0.05). Se elaboró un mapa conceptual que sustenta un razonamiento fisiológico al respecto. Conclusiones: El razonamiento fisiológico permite la enseñanza aprendizaje de los fundamentos de la Fisiología médica para la comprensión de la mejoraría de la oxigenación en paciente con distrés respiratorio por neumonía COVID-19 tratados con ventilación mecánica invasiva en decúbito prono.

Palabras claves: razonamiento médico; COVID-19; Decúbito prono; Ventilación mecánic